Les 32 équipes ont été réparties dans des chapeaux en fonction de leur classement et de leur zone géographique. En effet, aucun groupe ne pourra contenir plus de deux équipes européennes ou deux équipes issues d'une autre confédération.
Le tirage au sort a été effectué le 9 décembre 2005 à Leipzig, en Allemagne :
Chapeau 1 :
Têtes de série .Allemagne (organisateur) .Brésil (tenant du titre)
Espagne
Angleterre
Mexique
France
Italie
Argentine
Les têtes de séries sont choisies selon un classement combinant le classement FIFA sur les trois dernières années et les résultats dans les deux dernières Coupes du monde (1998 et 2002).
Chapeau 2 :
Afrique, Amérique du Sud et Océanie
Togo
Ghana
Tunisie
Côte d'Ivoire
Angola
Paraguay
Équateur
Australie
Le Paraguay et l'Équateur ne peuvent être dans le même groupe que le Brésil ou l'Argentine
Chapeau 3 :
Europe
Suisse
Pays-Bas
République tchèque
Ukraine
Croatie
Suède
Portugal
Pologne
Chapeau spécial :
Serbie-et-Monténégro
La Serbie-et-Monténégro possède le plus faible total des équipes européennes et sera automatiquement affectée au groupe du Brésil, de l'Argentine ou du Mexique.
Chapeau 4 :
Amérique du Nord et Asie
Corée du Sud
Japon
Iran
Arabie saoudite
États-Unis
Costa Rica
Trinité-et-Tobago
Si la Serbie-et-Monténégro tombe sur le Mexique, aucune restriction n'est nécessaire. Dans le cas contraire, États-Unis, Costa Rica et Trinité-et-Tobago ne peuvent affronter le Mexique.
